在远古的时代，宇宙中存在着分别代表光明与黑暗的两个文明，正如光与影永远是相互矛盾的，两个文明也长年处于战争之中，代表黑暗的文明为了取得胜利，就制造了一种高科技的战舰，这种战舰拥有超强的作战能力及穿越时空的能力，而且，还拥有自己的思想。然而，这种战舰却会把驾驶者作为自己的食粮，以此来增强自己的力量。这种黑色的战舰就像魔鬼一样，会把敌人彻底毁灭，但同时也会吞噬驾驶员的生命。而在同一时间，为了对抗敌人的黑色战舰，代表光明的文明也创造了一艘白色战舰与黑色战舰抗衡。后来，两个文明都原因不明地消失了，而那些战舰却依然存在在宇宙的某个角落里，新时代的人为他们起了个名字——遗失之舰（LostShips）故事发生的世界，是设定为Slayers中所称的“异世界”。故事重心围绕在“遗失之舰——飞天一号”上。而统治这个世界的魔王正是在中被消灭的异界魔王——黑暗之星。由于将精神力变换为能量的“精神物理学”的发达，产生了超越光速技术的遥远未来。主人公凯恩在这个世界里解决着发生的各种各样的事故，这种工作称之为“TROUBLE CONTRACTOR”(麻烦终结者，简称T.C）。凯恩（kane）的伙伴是加娜（Canal），表面上是人类，实际上是飞天一号的主电脑的立体投射映像。性格很可怕的，凯恩（kane）因为惹她生气而被扔出宇宙船（在宇宙中啊……生命啊）作为报复。另一个伙伴是想成为“宇宙第一”的米丽（米Mill），原来米丽（mill）是个侦探，因为凯恩（kane）的关系被解雇，也成为了T.C。米丽（mill）的枪法和料理都非常好……就是料理的时候厨房会遭殃……
当第一次接触《失落的宇宙》时，本以为它只是一部普通的科幻冒险动画，然而深入其中后才发现，它所构建的宏大世界观和深刻主题远超预期。这部作品以“异世界”为背景，将光明与黑暗的永恒对抗作为核心线索，通过一艘名为“神剑勇者号”的遗失战舰展开叙事，让人在追剧过程中逐渐被其复杂的设定和丰富的情感所吸引。
从角色塑造来看，主角凯恩作为“飞天一号”的驾驶员，并非传统意义上的完美英雄。他既有勇敢果断的一面，也时常展现出对自身使命的迷茫与挣扎。而与他搭档的智能AI凯娜儿，则以其冷静理智的分析能力和偶尔流露的人性温度，成为剧情中不可或缺的灵魂人物。两人之间的互动不仅推动了情节的发展，更揭示了科技与人性的微妙关系。此外，配角如侦探少女米莉的加入，也为故事增添了更多层次感，她的成长轨迹与主线紧密交织，使整个团队显得更加立体真实。
叙事结构方面，《失落的宇宙》采用了单元剧与主线并行的模式。前期通过一系列委托任务逐步铺垫世界观，同时埋下关于古代文明、遗失战舰技术以及凯恩身世的伏笔；后期则随着神秘组织“恶梦”的阴谋浮出水面，剧情节奏明显加快，最终导向一场关乎宇宙命运的决战。这种循序渐进的方式让观众能够慢慢融入设定之中，又不至于因信息过载而感到疲惫。
最令人印象深刻的是作品对“光暗对立”这一主题的处理。不同于简单的善恶二元论，动画借由远古文明的战争历史，探讨了力量本质与使用者意志之间的关系。黑色战舰虽象征毁灭，但其存在本身亦是秩序失衡下的必然产物；而白色战舰所代表的救赎之力，同样需要付出代价。这样的辩证思考贯穿全篇，赋予作品更深层的哲学意义。