钟大海是铭德篮球队的队长，一直在准备高校联赛的他，竟然在一夜之间变成了女生。医生答应帮助钟大海找到重新变回男儿之身的方法，但是在此之前，钟大海必须隐藏自己的真实身份，以钟言心（潘玥同 饰）的名字作为转校生在学校里生活下去。一下子失去了队长，篮球队濒临解散的边缘，钟言心求助于同校的青梅竹马陆星齐（王钧浩 饰），哪知道却连连遭到陆星齐的戏弄。最终，陆星齐答应钟言心帮助球队重振雄风，但是以此作为交换，钟言心必须成为拉拉队员。就这样，钟言心穿上了拉拉队服，哪知道却意外的绽放出了耀眼的光芒，与此同时，在和陆星齐交往过程中，钟言心发现自己竟然逐渐的对自己往日的好兄弟产生了别样的感情。
《我的队长不对劲》作为一部网络微短剧，以其独特的设定和轻松幽默的风格吸引了一部分观众。王钧浩与潘玥同的搭档组合为剧集注入了化学反应，尤其在处理身份错位的戏份时，既保留了喜剧所需的夸张感，又通过细腻的眼神戏传递出角色内心的挣扎与觉醒。导演侯昕炜在叙事上采用了快节奏的推进方式，每集都设计了多个戏剧冲突点，这种处理方式虽然符合当下观众追求高效娱乐的需求，但在某些关键情节的铺垫上略显不足，导致部分转折缺乏足够的情感支撑。
该剧最引人注目的是其脑洞大开的剧情设计，明显借鉴了日漫《变成黑皮辣妹后和朋友做了》的创意框架，但在本土化改造中尝试加入性别认知障碍的社会议题，这一创新值得肯定。不过从实际效果来看，由于剧本完成度的问题，最终呈现的反转显得生硬突兀，未能充分挖掘深层次的人性探讨，反而落入俗套的情感纠葛之中。两位男性配角的人物塑造相对扁平，更多时候扮演着推动剧情的工具人角色，这在一定程度上削弱了故事的整体质感。
制作层面，该剧展现出典型的现代网剧特征：镜头语言活泼跳脱，大量使用柔光滤镜营造浪漫氛围；场景切换频繁却缺乏记忆点；服化道方面虽无惊艳之处，倒也契合青春校园的基本调性。值得注意的是，剧中关于自我发现与成长的主题表达其实颇具潜力，可惜受限于篇幅和创作格局，往往浅尝辄止，未能展开更具深度的思考。对于追求视觉享受和即时快感的观众而言，这部作品或许能带来短暂的愉悦体验，但对那些期待看到新颖叙事或深刻内核的人来说，可能会感到些许失望。